Endoskopi yemek borusu, mide ve on iki parmak bağırsağını yani üst gastrointestinal sistemin incelemesine olanak veren bir tetkiktir. Ucunda bir kamera bulunan 8-12 cm uzunluğunda kıvrılabilen bir aletle yapılan güvenli bir yöntemdir. Endoskopi sırasında boğaza uygulanan lokal anestezik sprey ya da damardan bilinci ortadan kaldırmayan sakinleştirici yapılır. Bu işlem oldukça güvenli olmasına rağmen nadiren bazı yan etkiler görülebilir. Hastalarda işlemden sonra 1-2 gün kadar boğaz ağrısı olabilir. Eğer damardan sakinleştirici yapıldıysa birkaç saat uyuşukluk, uyku hali ya da yorgunluk hissedilebilir. Bunlar beklenen etkilerdir. Hastalarda nadir olarak solunum yolu enfeksiyonları görülebilir. Bazı hastalarda da işlem yapılırken nadiren üst solunum yolunda hasar oluşabilir. Bu nedenle enfeksiyon, kanama ya da bölgede delinme gibi sorunlar ortaya çıkabilir. Bunların dışında nadiren endoskopi sonrası 2 gün içinde giderek kötüleşen, normal mide ağrısına benzemeyen bulgular olursa, buna ateş, karın ağrısı, ağızdan kan gelmesi, kusma gibi belirtilerde eşlik ederse acilen doktorunuza görünmenizde yarar vardır.