Pilatesin zararları, pilates sırasında yapılan egzersizler günümüzde obezitenin önlenmesi amacıyla sıkça tavsiye edilen yöntemlerden biridir. Obezite toplumda en büyük sağlık sorunlarından biri olarak kabul edilmektedir. Çünkü obezite nedeniyle toplumda yüksek tansiyon, şeker hastalığı, kan yağlarının yükselmesi, kalp hastalıkları, bazı kanser türleri riski artmaktadır. Bu nedenle obeziteyi fiziksel aktivitelerle azaltma yolu her zaman kullanılan yöntemlerden biridir. Pilates doğru yapıldığında obezitenin zararlı etkilerinden korunmaya yardımcı olabilir. Fakat bilinçsiz olarak yapılırsa, insan vücudunda ciddi sayılacak hasarlar meydana getirebilir.

Son zamanlarda oldukça popüler olarak yapılan pilates, kliniklerde bile fizyoterapistler tarafından tedavi amacıyla kullanılan bir egzersizdir. Bunun hatalı yapılması, yanlış kişilerce uygulatılması halinde hastaların sayısı daha fazla artabilir. Özellikle televizyon gibi kitle iletişim araçlarıyla pilatesin daha geniş bir kesime ulaştırılması nedeniyle, diz hastalıklarına yakalananlarda sayıca artış olmuştur.

Uzmanlar insanların daha fazla fiziksel aktivite yapmasını tavsiye etse de bu bilinçsizce pilates yapılmasını kapsamamaktadır. Bu şekilde pilates yapan ve kliniklere gelen hasta sayısı sürekli olarak artmaktadır. Bunun mutlaka engellenmesi gerekir. Geçmişten beri var olan egzersiz topunun, pilates topu olarak toplumun içine girmesi ve bunun hatalı kullanılması sağlık sorunlarını beraberinde getirmiştir. Genellikle özürlü çocukların tedavi edilmesinde, sporcular için vücut stabilizasyonunda, bel ve boyun bölgesi ağrılarında kullanılan egzersiz topu, sorunların giderilmesine faydalı olmaktadır.

Pilatesin bilinçli olarak yapılması sırasında egzersizler yapılırken nefes kontrolü sağlanması ve vücut farkındalığı öğretilmektedir. Kişiler hem fiziki olarak hem de zihinsel gevşemeyi elde ederler. Kasların kuvvetlendirilmesi, dayanıklı hale getirilmesi pilatesin önceliğidir. Egzersizler sırasında gövde kasları sanki korse gibi kullanılır ve kol bacak kasları yardımıyla egzersizler zor hale getirilir. Hem hastalığı olanlar hem de sağlıklı kişiler bu egzersizleri tercih edebilir. Ayrıca evde uygulamak içinde pilates uygundur. Ancak uzmanların tavsiyeleri doğrultusunda yapılması önerilir.

Pilates yapan kişiler hasta ya da sağlıklı olmasına bakılmaksızın egzersizleri yaparken zor olan kısımlarında nefes vermeli, kolay olan kısımlarında nefes almalıdır. Bunu yaparak kasılmalar sırasında gevşeme gerçekleşecek ve dinlenmiş olacaklar. Nefes kontrolünün sağlanması yapılan aktivitelerle birlikte gelişecek, kişideki nefessizlik hissi ve enerji tüketimi azalacaktır. Böylece yorgunluk olmayacak, ağrı inhibisyonu oluşmayacaktır. Bedenin daha iyi kontrol edilmesi sağlanacaktır. Akıl ve beden bu egzersizlerle bütünleşmiş olacaktır.